对数控冲床主轴的结构要处理好卡盘或刀具的装夹、主轴的卸荷、主轴轴承的定位和间隙调整、主轴组件的润滑和密封及工艺上的一系列问题。为尽可能减少主轴组件温升引起的热变形对机床工作精度的影响，通常利用润滑油的循环系统把主轴组件的热量带走，使主轴组件与箱体保持恒定的温度，在某些数控冲床上采用专用的制冷装置，可以比较理想地实现温度控制。近十几年来，一些数控冲床的主轴轴承采用高级油脂，用封入方式进行润滑，每加一次油脂可以使用7-10年。为了使润滑油和油脂不致混合，通常采用迷宫式密封方式。
由于数控冲床主铀的两端安装着结构笨重的动力卡盘和夹紧液压缸，主轴刚度必须进一步提高，并应设计合理的连接端以改善动力卡盘与主轴端部的连接刚度。
数控冲床主轴端部的结构对工件或刀具的定位、安装、拆卸以及夹紧的准确、牢固、方便和可靠性有很大影响。常见的几种用于不同类型数控冲床主轴的端部结构如图6. 3所示，目前这些结构都已标准化，具体可参阅《机床主轴端部与花盘互换性尺寸HGB/T5900.1-3--1997》。